Первая команда в Сморгони увидела свет в 1978 году. Профессиональный футбольный клуб под названием «Станкостроитель» был основан в 1987 году. В чемпионатах Беларуси команда участвовала в 1992-1994, но показывала плохие результаты. В результате в 1994 году «Сморгонь» перешла в чемпионат области. В 1998 клуб вернулся в чемпионат страны, а в 2002 году вышел в Первую лигу. В 2006 году команда под руководством Георгия Кондратьева заняла второе место и вышла в Высшую лигу. В 2007-2009 годах «Сморгонь» играла в элитном дивизионе, где лучшим результатом стало восьмое место в 2008 году. В 2009 году «Сморгонь» заняла последнее место и опустилась в Первую лигу.